中國科學院南京土壤研究所成立于1953年，其前身為1930年創立的中央地質調查所土壤研究室。自成立以來，南京土壤研究所一直肩負著為中國農業發展和生態環境建設服務的重任，凝聚和培養了一大批優秀人才，面向全國的土壤資源，開展了一系列卓有成效的研究工作，先后榮獲國家級科技獎勵50余項，省部級科技獎勵200余項，逐步發展成為在土壤科學領域研究實力雄厚、分支學科齊全并在國際上享有較高聲譽的國家級研究中心和高級人才培養基地，為我國乃至世界土壤科學的發展做出了重要貢獻。　

一、發展目標 

二、人員狀況 

我所現有在編職工286人，其中專業技術人員247人。包括中科院院士2人，研究員47人，副高級研究人員69人。國家杰出青年基金獲得者6人，“百人計劃”及“引進國外杰出人才”入選者10人，國家“百千萬人才工程”7人，國家自然科學基金委委員會和中國科學院國際合作伙伴計劃團隊各1個。 

三、人才培養 

作為國家首批具有碩士和博士學位授予權的單位之一，目前擁有農業資源利用一級學科博士學位授予點，生態學和環境學二級學科博士學位授予點，擁有土壤學、植物營養學、生態學、環境科學、資源環境與遙感信息、地圖學與地理信息系統、水土保持與荒漠化防治7個碩士授予點，并建有1個博士后流動站。現有在讀博士研究生130多人,碩士研究生140多人。

四、研究及技術支撐機構設置 

圍繞土壤資源與管理、土壤肥力與調控、土壤環境與健康、土壤生物與安全4大重點領域，設有土壤與農業可持續發展國家重點實驗室、中國科學院土壤環境與污染修復重點實驗室、土壤資源與遙感應用研究室、土壤－植物營養與肥料研究室、土壤化學與環境保護研究室、土壤物理與鹽漬土研究室、土壤生物與生化研究室、土壤與環境生物修復研究中心、土壤利用與環境變化研究中心、農業生態與區域發展研究中心、封丘農業生態國家實驗站、紅壤農業生態國家實驗站、常熟農業生態國家實驗站、三峽工程生態環境秭歸實驗站、 CERN土壤分中心、南京土壤所－香港浸會大學土壤與環境聯合開放研究實驗室。此外，我所還主辦被SCI收錄為源刊的《PEDOSPHERE》（土壤圈）以及《土壤學報》、《土壤》等3份學術期刊；圖書館是聯合國糧農組織的特約圖書館，藏有中外文書籍和期刊25萬冊；土壤標本館保存和陳列了我國不同類型及部分其他國家的近6萬號土壤標本；土壤與環境分析測試中心是國家質量技術監督局認定的國家計量認證合格單位。另外，中國土壤學會、全國土壤質量標準化技術委員會和江蘇省土壤學會掛靠在我所。

五、項目與成果 

開展知識創新工程以來，我所推動并參與實施了國家在土壤學及其相關領域的所有重大科技計劃。截至目前，先后主持承擔了國家“973”項目4項，科技基礎性工作專項1項，重大科技專項課題4項,“863”重大、重點項目12項，科技支撐計劃項目1項和課題10余項，公益性行業科技重大專項4項，國家自然科學基金重大項目2項、國際合作重大項目9項等一大批國家重大科技任務，充分體現了我所在土壤學及其相關研究領域的主導地位和整體競爭實力。近5年來，獲得2項國家自然科學獎、13項省部級科技進步獎，累計發表SCI論文746篇，國內核心期刊論文1440余篇，出版學術專著25部，有56項發明專利獲得授權。

六、交流與合作 

我所先后與30多個國家和地區建立了合作研究關系，與英國洛桑試驗站、蘇格蘭作物科學研究所、日本農業環境研究所、澳大利亞Melbourn大學、Griffith 大學等一批國際著名研究機構和大學簽訂了長期全面合作協議。擁有與香港浸會大學共建的"土壤與環境聯合開放研究”實驗室，并作為全球數字土壤制圖亞洲中心，承擔領導亞洲地區數字土壤制圖的工作。